近日，“自然亚洲”（natureasia）网站发布了“2012年亚太地区自然出版指数”的报告，日本东京大学名列第一，中国科学院第二。在排名前十位的机构中，日本占了6家，中国2家，澳大利亚和新加坡各1家。

该排名基于2012年在《自然》杂志及其子刊发表的原始研究文章进行统计，分别计算出各研究机构发表文章数量和贡献点数。此排名则是以贡献点数（corrected count）为标准。

据了解，科研机构和科研城市的贡献点数计算方法如下：每篇论文为1分，假定每个作者在每篇文章中的贡献是等同的，分数归属其所依托的科研机构。如一篇文章有4个作者，其中2个作者来自中科院，中科院将从该论文获得0.5分。

报告显示，许多年来，日本一直主导亚太地区的科研；但是，通过自然出版指数的数据来看，亚太地区高质量的研究正在转向中国、新加坡等国。比如，2011年排名第一的东京大学贡献点数为42.82，中国科学院为22.52，而2012年，东京大学贡献点数为39.72，中国科学院为37.88。据最新的滚动数据（2012年3月19日至2013年3月18日）分析，中国科学院以48.92的贡献点数，超越东京大学（贡献点数为35.62），稳居亚太地区第一名。按照目前的趋势，中科院在2013年度的排名有望超越东京大学，跃居亚太地区榜首。

从世界范围的排名来看，哈佛大学以152.11的贡献点数高居第一，比第二名的斯坦福大学高出75.77。德国马普研究院、法国国家科研中心和美国国立卫生研究院分列第三、五、六名，东京大学和中国科学院分列第八和第十二名。

该报告还发布了在《自然》及各子刊发文机构前五名以及日本、中国、澳大利亚、韩国和新加坡的国内机构排名。中国研究机构的排名，位于前十位的分别是中国科学院、中国科技大学、清华大学、北京大学、上海交通大学、华大基因、浙江大学、华中科技大学、复旦大学和香港大学。